温度对草鱼代谢相关基因转录组分析结果

鱼类是变温动物，其体温随水温变化而变化，不能通过新陈代谢活动来保持自身温度的恒定。草鱼的最佳生长温度范围为25℃-30℃，高温养殖环境会对其生存、生长、代谢和免疫造成影响。因此，中国水产科学研究院淡水渔业研究中心任鸣春研究员团队通过比较适宜温度组（27℃）与高温处理组（33℃）草鱼的转录组学数据，探讨草鱼响应高温胁迫的分子机制，以获得高温胁迫条件下草鱼营养代谢相关的基因资源。研究结果表明：（1）测序共产生了279,398,348个原始读数，每个文库获得了大约40.7-51.8 M质量剪切后，单一映射的转录本百分比范围为 80.13% 至 84.58%；（2）高温胁迫下共鉴定出260个差异表达基因（DEGs），其中84个基因上调，176个基因下调；（3）对DEGs进行GO和KEGG富集分析，结果表明大部分DEGs参与蛋白质、脂质和碳水化合物代谢。综上所述，高温胁迫可抑制草鱼幼鱼蛋白质及脂肪酸合成、减弱碳水化合物代谢能力。该研究成果已被Gene 杂志接收。

论文题目：Huang D, Ren M*, Liang H, Ge X, Xu H, Wu L.Transcriptome analysis of the effect of high-temperature on nutrient metabolism in juvenile grass carp (Ctenopharyngodon idellus).

发表时间：2021.10.21

原文链接：https://doi.org/10.1016/j.gene.2021.146035